噴霧式干燥機價格較高，組成復雜，使用和維護難度較大。噴霧式干燥機的良好運轉，不僅能夠保證生產的正常進行，還可以適當延長噴霧式干燥機使用壽命，降低生產成本，因此對噴霧式干燥機的正確操作以及加強維護保養十分必要。
噴霧式干燥機正常運行后，應定時收料、定時檢查各系統運行情況，記錄各工藝參數。結束時，應首先關停加熱裝置，并用水來代替料液以沖洗料管殘留料液，然后關閉料泵。當進口溫度減低到100℃以下后可以停止送風機和抽風機的運行。接著清理干燥器和除塵器內余料，關閉除塵器及氣錘，zui后關閉總電源，完成生產操作。如遇緊急情況，必須立即關停設備，應首先關停送風機和料泵。如果突遇停電，應使塔體自然降溫，然后打開排污閥，排盡料漿管道內漿料，并清洗設備。
噴霧式干燥機長時間運行或因操作不當，部分噴霧造粒干燥塔內會出現集料而影響正常運行，此時需停止工作進行清洗，對于干燥塔內集料的清理，應打開清掃門，用長把掃帚掃除漏斗形底部集料，打開出料閥，開冷凍機時，必須開循環水，用自來水沖洗塔內。
此外，使用完畢后應將噴霧盤拆下，浸入水中，把殘留物質用水清洗干凈。在用清水洗不掉時，應用刷子刷洗。因為噴霧盤上的殘留物質會帶來噴霧不平衡度，嚴重影響噴頭的使用壽命甚至損壞其它機件。噴頭工作完畢后和運輸過程中切忌臥放。安放不正確，會使主軸彎曲，影響使用，因此安放應有固定架。
經過600h左右的運轉，需對噴霧式干燥機進行必要的檢查與養護。對于供料系統，應檢查過濾器、管道、閥門、噴嘴等，看有無堵塞，定時清洗，檢查噴嘴磨損情況以便及時更換。
經過600h左右的運轉，應檢查料泵是否漏油，打壓是否正常，油位是否正常等。對噴霧式干燥機的風機，應查看軸和軸承是否缺油發熱，有無震動、噪音等，必要時清洗油管、油泵、油嘴三處的過濾網。
如遇緊急情況，必須立即關停設備，應首先關停送風機和料泵。如果突遇停電，應拉出燃氣機，噴霧式干燥塔體自然降溫，然后打開排污閥，排盡料漿管道內漿料，并清洗設備。
為保證噴霧式干燥塔體及其管道和所有與成品接觸的部件的清洗，得到*的產品，有規則的清洗設備是十分必要的。當產品品種更換時，或是設備已經停產24h以上而未清洗的，應作一次全面*的清洗。
清洗方法，可根據實際選擇干洗、濕洗或化學洗。
干洗：用刷子、吸塵器清掃（適用于小型干燥機）。
濕洗：用60~80℃的熱水進行清洗。
化學洗：用堿液、酸液和各種洗滌劑清洗。其中，酸洗：將HNO3配成1~2%濃度的溶液，加熱溫度不超過65℃進行洗滌，然后用水清洗；堿洗：將NaOH配成0.5~1%濃度的溶液，加熱溫度不超過65℃進行洗滌，然后用清水清洗。
當進行濕洗和化學洗滌后，應將設備和各部件安裝好，進行高溫消毒，時間15~30min。
在設備清洗時，注意不能用氯及其化合物洗滌。
空氣過濾器的清洗，應按周圍環境條件，即空氣含塵量的高低而定，一般含量高的3~6星期清洗一次，含塵量低的6~8星期清洗一次。其中的不銹鋼細絲，用堿洗法洗滌后，仍應均勻地敷設到空氣過濾器的框架內，并噴以輕質錠子油或真空泵油。
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